Erbaut in der Mitte von 1500 war die Santa Maria delle Grazie im Jahre 1600 gewidmet. Es hat eine Tür, über dem, in einer kleinen Blende, zeigt eine Madonna mit Kind, San Francisco und San Michele Arcangelo.
Zwei Gedenktafeln, von der Stadt San Giovanni Rotondo gelegt, erinnere 10. August 1910 (zum Priester geweiht St. Pius) und das Jahr 1916 (der Mönch’s Ankunft in San Giovanni Rotondo).
Im Inneren fällt sofort der Altar von San Francesco, die von Pater Pio für die Feierlichkeiten verwendet wird, das Kruzifix, vor dem er erhielt die Wundmale – befindet sich im obersten Stockwerk – und im Beichtstuhl, wo er verbrachte ganze Tage zu hören und Komfort für alle seine Gläubigen.
